Download onze AI in het bedrijfsleven | Mondiaal trendrapport 2023 en blijf voorop lopen!
Gepubliceerd: 20 mei 2026

Machine learning in de farmaceutische industrie: een gids voor de AI-revolutie van 2026

Gratis AI-consultatiesessie
Ontvang een gratis service-offerte
Vertel ons over uw project - wij sturen u een offerte op maat

Korte samenvatting: Machine learning transformeert de farmaceutische ontwikkeling door de ontdekking van nieuwe geneesmiddelen te versnellen, het ontwerp van klinische studies te verbeteren en de besluitvorming door regelgevende instanties te versterken. Nu de FDA en EMA in 2026 gemeenschappelijke AI-principes vaststellen, voorspellen ML-modellen geneesmiddelinteracties, optimaliseren ze formuleringen en identificeren ze patiëntengroepen met een ongekende nauwkeurigheid. Er blijven echter uitdagingen bestaan op het gebied van datakwaliteit, transparantie van modellen en het succespercentage van fase I tot goedkeuring (gemiddelde in de sector) van ongeveer 8-101 TP3T, dat ML juist wil verbeteren.

 

De farmaceutische industrie staat op een kruispunt. De ontwikkeling van geneesmiddelen kost traditioneel meer dan een miljard dollar en beslaat 10 tot 15 jaar van uitputtende trials en fouten. Ondanks deze enorme investeringen ligt het algehele succespercentage van fase I klinische studies tot FDA-goedkeuring gemiddeld rond de 8 tot 101 miljoen (met lagere percentages in gebieden met een hoog uitvalpercentage zoals oncologie). Dit cijfer is gebaseerd op geaggregeerde analyses van de industrie over tienduizenden geneesmiddelen.

Machine learning biedt een fundamenteel andere aanpak. Door algoritmen te leren patronen te herkennen in miljoenen datapunten, kunnen farmaceutische onderzoekers in elke fase slimmere beslissingen nemen – van het identificeren van veelbelovende moleculaire structuren tot het voorspellen welke patiënten op een behandeling zullen reageren.

En het regelgevingslandschap heeft zich hierop aangepast. Op 14 januari 2026 hebben het EMA en de FDA gezamenlijk tien principes vastgesteld voor goede praktijken op het gebied van kunstmatige intelligentie gedurende de gehele levenscyclus van geneesmiddelen. Dit is de eerste keer dat wereldwijde regelgevende instanties overeenstemming hebben bereikt over AI-standaarden voor de ontwikkeling van geneesmiddelen.

Maar er is iets belangrijks om te weten: niet alle ML-toepassingen leveren evenveel waarde op. Sommige modellen blinken uit in het nauwkeurig voorspellen van interacties tussen geneesmiddelen en hun doelwitten met behulp van reinforcement learning. Andere modellen presteren juist minder goed dan eenvoudige basismodellen wanneer ze met nieuwe verbindingen te maken krijgen.

Inzicht in machinaal leren in de farmaceutische context

Machine learning verwijst naar algoritmen die hun prestaties verbeteren door ervaring in plaats van door expliciete programmering. In de farmaceutische industrie betekent dit systemen die leren om eigenschappen van geneesmiddelen te voorspellen, ziektepatronen te identificeren of formuleringen te optimaliseren door duizenden eerdere voorbeelden te analyseren.

De FDA definieert kunstmatige intelligentie (AI) als "een machinegebaseerd systeem dat, voor een gegeven reeks door mensen gedefinieerde doelstellingen, voorspellingen, aanbevelingen of beslissingen kan doen die van invloed zijn op reële of virtuele omgevingen." Deze systemen nemen gegevens waar, abstraheren deze tot modellen door middel van geautomatiseerde analyse en gebruiken modelinferentie om uitvoerbare opties te formuleren.

Drie kernbenaderingen van machine learning domineren farmaceutische toepassingen:

  • Supervised learning traint op gelabelde datasets: moleculen voorzien van labels met hun biologische activiteit, patiënten gecategoriseerd op basis van hun respons op de behandeling. Classificatiemodellen en random forest-benaderingen laten sterke prestaties zien bij het voorspellen van biomarkerprofielen en het analyseren van medicamenteuze behandelingen.
  • Ongecontroleerd leren vindt verborgen patronen zonder vooraf gedefinieerde labels. Deze algoritmen groeperen vergelijkbare verbindingen, identificeren subgroepen van patiënten of detecteren afwijkingen in productiegegevens die menselijke waarnemers over het hoofd zien.
  • Reinforcement learning optimaliseert opeenvolgende beslissingen door middel van vallen en opstaan. Machine learning-benaderingen, waaronder reinforcement learning, tonen een hoge nauwkeurigheid bij het scoren van moleculaire bindingsfuncties – ze leren welke chemische modificaties de interactie tussen geneesmiddel en doelwit verbeteren.

Eerlijk gezegd: 801 TP3T aan machine learning-werk betreft dataverwerking en -opschoning, terwijl slechts 201 TP3T wordt besteed aan de toepassing van algoritmen. De farmaceutische industrie genereert dagelijks enorme hoeveelheden data – klinische dossiers, genoomsequenties, beeldvormingsstudies, chemische structuren. Maar ruwe data alleen is niet voldoende voor machine learning. Het vereist standaardisatie, validatie en zorgvuldige selectie.

Toepassingen voor geneesmiddelenontdekking en -ontwerp

Geneesmiddelenontwikkeling begint met het identificeren van moleculen die zich binden aan therapeutische doelen. Traditioneel synthetiseerden en testten onderzoekers duizenden verbindingen in de hoop een paar veelbelovende kandidaten te vinden. Machine learning versnelt dit proces door te voorspellen welke moleculaire structuren succesvol zullen zijn vóór de synthese.

Doelidentificatie en -validatie

Eiwit-eiwitinteracties sturen cellulaire processen aan en vormen waardevolle aangrijpingspunten voor geneesmiddelen. Deep learning-modellen bereiken een hoge nauwkeurigheid bij het valideren van eiwit-eiwitinteracties met behulp van grote datasets van bevestigde eiwitparen.

Het model vertoont een hoge gevoeligheid en specificiteit in de verschillende validatiegegevenssets en identificeert welke eiwitinteracties ziekteprocessen aansturen en aanknopingspunten bieden voor medicamenteuze interventie.

Genomische data voegen een extra dimensie toe. Machine learning-modellen tonen aan dat ze in staat zijn om aanzienlijke delen van de polygene variantie te verklaren met behulp van data over enkelvoudige nucleotidepolymorfismen. Hoewel deze specifieke toepassingen zich richten op complexe eigenschappen, worden met vergelijkbare benaderingen genetische varianten geïdentificeerd die verband houden met de respons op medicijnen en de vatbaarheid voor ziekten.

Moleculaire structuurvoorspelling

Het ontwerpen van geneesmiddelen vereist een evenwicht tussen meerdere eigenschappen: werkzaamheid ten opzichte van het doelwit, opname in het lichaam, minimale bijwerkingen en chemische stabiliteit. Machine learning-modellen evalueren deze afwegingen in een enorme chemische ruimte met miljarden potentiële verbindingen.

Het SPARROW-algoritme vertegenwoordigt recente ontwikkelingen op dit gebied. Het is ontwikkeld aan het MIT en identificeert automatisch optimale moleculen uit enorme bibliotheken die als potentiële geneesmiddelen getest kunnen worden, waarbij rekening wordt gehouden met de talloze factoren die elke keuze beïnvloeden.

Structuurgebaseerde virtuele screening verwerkt nu razendsnel chemische ruimtes op gigaschaal. Snelle iteratieve screeningmethoden reduceren miljarden kandidaatmoleculen tot honderden die de moeite waard zijn om te synthetiseren, waardoor de tijd en kosten in de vroege ontdekkingsfase drastisch worden verlaagd.

Formuleringsontwikkeling

Zodra een veelbelovend molecuul is ontdekt, moeten formuleringsexperts bepalen hoe dit effectief kan worden toegediend. Injecteerbare geneesmiddelen met een lange werkingsduur bieden een verbeterde werkzaamheid en therapietrouw bij chronische ziekten, maar het ontwerpen van deze complexe systemen op basis van polymeren vereist doorgaans uitgebreid experimenteren.

Machine learning-modellen voorspellen de afgifteprofielen van geneesmiddelen uit polymeerformuleringen door fysisch-chemische eigenschappen te analyseren: moleculair gewicht, polair oppervlak, aantal heteroatomen, smelttemperatuur en verdelingscoëfficiënt. Door training op 80% van geneesmiddel-polymeercombinaties en testen op de resterende 20%, sturen deze modellen het ontwerp van formuleringen en verkorten ze de ontwikkeltijd.

De wisselwerking tussen de eigenschappen van een geneesmiddel en de kenmerken van een polymeer maakt intuïtieve voorspellingen vrijwel onmogelijk. Machine learning kan deze multidimensionale relaties wel aan en identificeert optimale formuleringen zonder uitgebreide laboratoriumtests.

Optimalisatie van klinische onderzoeken

Klinische studies vormen de duurste en meest tijdrovende fase van geneesmiddelenontwikkeling. Slechts 12%-programma's slagen erin om van fase 1 naar de productlancering te komen. Patiëntenwerving neemt een aanzienlijk deel van de ontwikkeltijd in beslag en brengt aanzienlijke kosten met zich mee voor de hele sector.

De planning van fase 3-onderzoeken en de tijdlijn voor de patiëntenwerving beslaan maanden voordat de tests beginnen. Machine learning pakt deze inefficiënties vanuit meerdere invalshoeken aan.

Patiëntstratificatie en werving

Niet alle patiënten reageren identiek op een behandeling. Genomische varianten, ziekte-subtypen en comorbiditeiten creëren heterogene populaties waarin medicijnen sommige individuen wel helpen en anderen niet. Traditionele onderzoeken mengen deze groepen vaak, waardoor positieve signalen worden verzwakt en het aantal mislukkingen toeneemt.

Machine learning maakt nauwkeurige patiëntselectie mogelijk. Classificatiemodellen analyseren elektronische patiëntendossiers, genetische profielen en biomarkergegevens om personen te identificeren die het meest waarschijnlijk baat zullen hebben bij experimentele therapieën. Deze stratificatie verbetert de slagingskans van klinische studies en versnelt de werving van geschikte kandidaten.

Platformen voor fenotypische screening met een hoge informatiedichtheid, gecombineerd met machine learning, identificeren patiëntsubgroepen op basis van cellulaire responspatronen. Bedrijven zoals Recursion en Janssen passen deze methoden toe voor het ontdekken van targets, het identificeren van hits en toxiciteitstesten – met behulp van celbeeldgegevens die traditionele analyses grotendeels negeren.

Dosisselectie en veiligheidsbewaking

Het bepalen van een veilige en effectieve dosering vereist een afweging tussen therapeutisch voordeel en bijwerkingen. Machine learning-modellen voorspellen dosis-responsrelaties op basis van preklinische gegevens, en bieden zo een leidraad voor de initiële dosisselectie bij mensen en daaropvolgende dosisverhogingsstrategieën.

Tijdens klinische studies detecteren realtime veiligheidsmonitoringsalgoritmen patronen van bijwerkingen eerder dan conventionele methoden. Deze systemen signaleren potentiële toxiciteitssignalen door verzamelde klinische gegevens te analyseren, waardoor sneller kan worden ingegrepen wanneer problemen zich voordoen.

Adaptieve onderzoeksopzetten maken gebruik van machine learning om protocollen aan te passen op basis van tussentijdse resultaten – bijvoorbeeld door patiënten opnieuw toe te wijzen aan veelbelovendere behandelingsgroepen, doseringen aan te passen of de inclusiecriteria te verrijken. Deze flexibiliteit verbetert de efficiëntie en behoudt tegelijkertijd de statistische nauwkeurigheid.

Eindpuntvoorspelling en succes van de proef

Klinische eindpunten bepalen of onderzoeken slagen of mislukken. Machine learning-modellen voorspellen het behalen van het primaire eindpunt aan de hand van vroege biomarkers, basiskenmerken en tussentijdse metingen. Deze voorspellingen helpen sponsors bij het nemen van beslissingen voordat ze investeren in langdurige en kostbare studies.

Toch blijven er uitdagingen bestaan. Modellen die getraind zijn op één ziekte of populatie falen vaak wanneer ze in andere contexten worden toegepast. Het hoge percentage mislukkingen bij de klinische ontwikkeling van 90% blijft aanhouden, ondanks de vooruitgang in computertechnologie. Dit benadrukt dat machine learning het menselijk oordeel en rigoureus wetenschappelijk onderzoek aanvult in plaats van vervangt.

Ondersteuning bij regelgevingsbeslissingen

Op 6 januari 2025 publiceerde de FDA een conceptrichtlijn over het gebruik van kunstmatige intelligentie bij de ontwikkeling van geneesmiddelen en biologische producten. De conceptrichtlijnen hebben betrekking op AI-systemen die bedoeld zijn om regelgevende beslissingen over de veiligheid, werkzaamheid of kwaliteit van een product te ondersteunen.

In verklaringen van de commissaris werd de inzet van het agentschap benadrukt om innovatieve benaderingen te ondersteunen en tegelijkertijd strenge normen te waarborgen. De richtlijnen bieden een kader om de geloofwaardigheid van AI-modellen die gedurende het ontwikkelingsproces worden gebruikt, te vergroten.

De gezamenlijke principes van de FDA en de EMA

Naar aanleiding van de richtlijnen van de FDA uit januari 2025 hebben de twee instanties op 14 januari 2026 gezamenlijk tien principes voor goede AI-praktijken vastgesteld. Deze principes bestrijken de gehele levenscyclus van geneesmiddelen, van vroeg onderzoek tot monitoring na marktintroductie.

De belangrijkste thema's zijn:

  • Transparantie en uitlegbaarheid: Toezichthouders moeten begrijpen hoe AI-modellen tot conclusies komen.
  • Kwaliteit en representativiteit van de gegevens: Trainingsgegevens moeten een afspiegeling zijn van diverse populaties en gebruikssituaties.
  • Validatie en prestatiebewaking: Modellen vereisen strenge tests en continue monitoring.
  • Menselijk toezicht: AI ondersteunt menselijke besluitvorming in plaats van deze te vervangen.
  • Ethische overwegingen: Systemen moeten de privacy respecteren, vooringenomenheid vermijden en gelijke toegang bevorderen.

Het reflectiedocument van het Europees Geneesmiddelenagentschap over AI in de levenscyclus van geneesmiddelen behandelt een vergelijkbaar onderwerp. Het benadrukt principes die relevant zijn voor de toepassing van AI en machine learning in elke ontwikkelingsfase, inclusief productie, farmacovigilantie en klinische besluitvormingsondersteuning.

Kwalificatie-oordelen en praktijktoepassingen

Het EMA geeft kwalificatieadviezen af voor op AI gebaseerde instrumenten. Een kwalificatieadvies voor op AI gebaseerde meting van de histologie van niet-alcoholische steatohepatitis in leverbiopsieën was beschikbaar voor openbare raadpleging tussen december 2024 en januari 2025. Dit toont aan dat de regelgevende instanties gevalideerde machine learning-instrumenten voor eindpuntbeoordeling accepteren.

Deze formele kwalificaties bieden de zekerheid dat AI-metingen voldoen aan de wettelijke eisen wanneer ze worden gebruikt in cruciale klinische studies. Het proces evalueert de modelprestaties, de datakwaliteit, de validatiemethodologie en de klinische relevantie.

Regelgevende instanties komen steeds vaker AI tegen bij het beoordelen van aanvragen. Software as a Medical Device (SaMD)-toepassingen maken vaak gebruik van machine learning voor diagnostische interpretatie, behandelingsaanbevelingen of patiëntmonitoring. Het lopende onderzoek van de FDA naar op AI/ML gebaseerde SaMD legt de basis voor deze continu lerende systemen.

Versnel farmaceutische innovatie met geavanceerde machine learning.

De farmaceutische industrie kent talloze complexe uitdagingen, waaronder data-analyse, optimalisatie van onderzoek en ontwikkeling en operationele efficiëntie. AI Superieur Helpt farmaceutische bedrijven machine learning in te zetten om betere besluitvorming te realiseren, workflows te automatiseren en bruikbare inzichten te verkrijgen uit grote datasets.

Ontdek slimmere oplossingen voor de farmaceutische industrie met AI.

AI Superior levert:

  • Aangepaste machine learning-modellen voor het analyseren van grote farmaceutische datasets
  • Voorspellende analyses ter ondersteuning van onderzoeks- en ontwikkelingsstrategieën
  • AI-gestuurde oplossingen voor het verbeteren van operationele workflows en efficiëntie.

👉Neem contact op met AI Superior Om te bespreken hoe machine learning uw farmaceutische activiteiten en onderzoeksprocessen kan verbeteren.

Uitdagingen en oplossingen bij de implementatie

Ondanks veelbelovende toepassingen stuit machine learning in de farmaceutische industrie op aanzienlijke obstakels. Inzicht in deze uitdagingen helpt organisaties om AI effectief te implementeren, in plaats van zich te laten leiden door hype en uiteindelijk te mislukken.

Kwaliteit en beschikbaarheid van gegevens

Hoogwaardige data vormen de basis voor succesvolle machine learning. Maar farmaceutische databronnen staan erom bekend dat ze vaak rommelig zijn: inconsistente formaten, ontbrekende waarden, meetfouten, batch-effecten en verstorende variabelen teisteren datasets.

Onthoud: 801 TP3T aan machine learning-werk gaat naar het opschonen en verwerken van data, terwijl slechts 201 TP3T wordt besteed aan algoritmes. Organisaties onderschatten dit vaak en verwachten snelle resultaten van geavanceerde modellen die worden toegepast op onbewerkte data.

Het probleem wordt verergerd door de kleine omvang van de datasets. Terwijl technologiebedrijven voor consumenten hun modellen trainen op miljoenen voorbeelden, hebben farmaceutische projecten vaak honderden verbindingen, tientallen patiënten of een beperkt aantal experimentele herhalingen. Few-shot learning-methoden lijken veelbelovend voor kleine datasets (minder dan 50 moleculen), maar de prestaties blijven inconsistent.

Datadiversiteit is net zo belangrijk als de kwantiteit. Modellen die getraind zijn op een beperkt aantal chemische stoffen of homogene patiëntenpopulaties generaliseren slecht. Een benchmarkstudie uit 2025 naar deep learning-modellen voor het voorspellen van de werkzaamheid van geneesmiddelen tegen kanker (gepubliceerd op 1 juli 2025) toonde aan dat alle algoritmen een aanzienlijk lagere nauwkeurigheid vertoonden wanneer ze werden getest op onbekende stoffen in vergelijking met willekeurig verdeelde trainingsdata.

Modelselectie en prestaties

Het 'no-free lunch'-theorema stelt dat geen enkel algoritme in alle mogelijke taken uitblinkt. Recent onderzoek heeft een 'optimale zone' voor verschillende machine learning-benaderingen geïdentificeerd, gebaseerd op de grootte en diversiteit van de dataset:

  • Kleine datasets (minder dan 50 moleculen): Few-shot learning-modellen presteren beter dan zowel klassieke machine learning als transformermodellen.
  • Kleine tot middelgrote datasets (50-240 moleculen) met een hoge diversiteit: Transformer-modellen (zoals MolBART) presteren beter dan klassieke en few-shot-benaderingen.
  • Grotere datasets met voldoende omvang: Klassieke modellen (support vector regression, random forests) presteren het beste.

Dit raamwerk helpt teams bij het selecteren van geschikte algoritmen in plaats van automatisch voor de nieuwste architectuur te kiezen. Context is belangrijker dan modelcomplexiteit.

Belangrijk is dat verschillende deep learning-algoritmen in veel tests het basismodel niet significant konden overtreffen. Een op het gemiddelde gebaseerd basismodel – dat de gemiddelde waarde uit de trainingsgegevens voorspelt – presteerde verrassend goed in vergelijking met geavanceerde neurale netwerken, met name voor onbekende verbindingen.

Interpretatievermogen en vertrouwen

Blackbox-modellen zorgen voor wrijving in farmaceutische toepassingen waar inzicht in causaliteit van belang is. Regelgevers, artsen en wetenschappers hebben behoefte aan verklaringen, niet alleen aan voorspellingen.

Technieken zoals SHAP (SHapley Additive exPlanations) en LIME (Local Interpretable Model-agnostic Explanations) helpen bij de interpretatie van complexe modellen door aan te tonen welke kenmerken de grootste invloed hadden op specifieke voorspellingen. Deze methoden lossen interpretabiliteitsproblemen niet volledig op, maar bieden wel nuttige inzichten in het gedrag van modellen.

Eenvoudigere modellen – beslissingsbomen, lineaire regressies, op regels gebaseerde systemen – bieden inherente interpreteerbaarheid ten koste van verminderde prestaties bij complexe taken. De afweging tussen nauwkeurigheid en verklaarbaarheid vereist zorgvuldige overweging, gebaseerd op de belangen van de toepassing en wettelijke vereisten.

UitdagingInvloedOplossingsaanpakAdoptiestatus 
Problemen met de datakwaliteit801 TP3T aan ML-inspanning besteed aan opschoning versus 201 TP3T aan algoritmes.Gestandaardiseerde datapijplijnen, geautomatiseerde validatieOp grote schaal geïmplementeerd
Kleine datasetsModellen schieten tekort bij nieuwe verbindingen; few-shot learning is nodig.Transferleren, dataverrijking, kennisdeling tussen bedrijvenOpkomende praktijken
Model interpreteerbaarheidRegelgevende en klinische acceptatie vereist verklaarbaarheid.SHAP, LIME, eenvoudigere modelarchitecturenGedeeltelijk behandeld
IC50-variabiliteitVariatie in potentiemetingen van 400% tussen verschillende protocollen.Gestandaardiseerde analyses, ensemblevoorspellingenIn ontwikkeling
Falen van generalisatieDe nauwkeurigheid neemt sterk af bij onzichtbare chemische structuren.Diverse trainingssets, op een steiger gebaseerde splitsingActief onderzoeksgebied

Organisatorische en culturele barrières

Technische uitdagingen vallen in het niet bij de weerstand binnen de organisatie. Farmaceutische bedrijven hebben werkprocessen, regelgeving en een risicomijdende cultuur die de acceptatie van AI vertragen.

Uit enquêtegegevens blijkt dat ongeveer 36,91 TP3T farmaceutische organisaties nog niet begonnen waren met het gebruik of de implementatie van AI/ML in belangrijke ontwikkelingsactiviteiten. Nog eens 30,31 TP3T waren net begonnen met de implementatie of een pilotproject, 22,11 TP3T waren gedeeltelijk bezig met de implementatie en slechts een minderheid was verder gekomen dan de pilotfase.

Succesvolle implementatie vereist samenwerking tussen verschillende disciplines: datawetenschappers die samenwerken met medicinale chemici, artsen, regelgevingsdeskundigen en productiespecialisten. Deze groepen spreken verschillende talen, geven prioriteit aan verschillende meetwaarden en benaderen problemen vanuit verschillende perspectieven.

Trainingsprogramma's helpen deze kloof te overbruggen. Organisaties moeten domeinexperts voorlichten over de mogelijkheden en beperkingen van machine learning, terwijl ze datawetenschappers tegelijkertijd farmaceutische principes bijbrengen. Hybride functies – personen met diepgaande expertise op beide gebieden – blijken bijzonder waardevol, maar zijn nog schaars.

Succesverhalen uit de praktijk

Los van de hype en de theoretische mogelijkheden, hebben verschillende organisaties de meetbare impact van machine learning in de farmaceutische sector aangetoond.

Recursie en beeldvorming met hoge inhoud

Recursion combineert fenotypische screening met een hoge informatiedichtheid met machine learning om inzichten te verkrijgen uit cellulaire beeldgegevens. Hun platform legt miljoenen celbeelden vast onder verschillende behandelingsomstandigheden en past vervolgens deep learning toe om subtiele fenotypische veranderingen te identificeren.

Deze aanpak maakt het mogelijk om doelen te ontdekken, potentiële geneesmiddelen te identificeren en toxiciteit te voorspellen door biologische patronen te herkennen die voor het menselijk oog onzichtbaar zijn. Samenwerkingen met grote farmaceutische bedrijven bevestigen de commerciële haalbaarheid van deze op machine learning gebaseerde strategie.

DeepCDR, DrugCell en voorspellingen voor kankermedicijnen

In een benchmarkstudie werden vijf deep learning-modellen geëvalueerd voor het voorspellen van de werkzaamheid van antikankermedicijnen (IC50-waarden): DeepCDR, DrugCell, PaccMann, Precily en tCNN. Voor de tests werden gestandaardiseerde GDSC-datasets en recent gepubliceerde antikankerverbindingen gebruikt.

Uit de resultaten bleek dat DeepCDR, DrugCell en tCNN in de meeste scenario's een licht voordeel hadden, hoewel alle modellen over het algemeen vergelijkbaar presteerden. Ze blonken uit op willekeurig verdeelde data en onbekende cellijnen, maar hadden moeite met nieuwe chemische verbindingen, wat de uitdagingen op het gebied van generalisatie benadrukt.

Belangrijk is dat deze geavanceerde architecturen in veel tests de basislijn niet significant konden overtreffen. Deze ontnuchterende bevinding onderstreept dat modelcomplexiteit geen garantie is voor betere prestaties.

De beoordeling van de voorspellingsfout ten opzichte van de fysisch-chemische en biologische eigenschappen van verbindingen en cellijnen bracht een zwakke correlatie aan het licht, wat wijst op een onderbelicht aspect van de modelprestaties.

Ontwerp van een langwerkende injecteerbare formulering

Onderzoekers hebben machine learning toegepast om de afgifte van geneesmiddelen uit langwerkende injecteerbare geneesmiddelen op polymeerbasis te voorspellen. Deze formuleringen bieden een verbeterde therapeutische werkzaamheid, veiligheid en therapietrouw bij chronische ziekten, maar het ontwerpen ervan vereist traditioneel veel experimenten.

De ML-modellen analyseerden het molecuulgewicht van het geneesmiddel, het polaire oppervlaktegebied, het aantal heteroatomen, de smelttemperatuur, de zuur dissociatieconstante, de verdelingscoëfficiënt en de bijbehorende polymeereigenschappen. De modellen, getraind op 80% aan formuleringgegevens, voorspelden met succes de afgifteprofielen voor de resterende 20%.

Deze datagestuurde aanpak reduceert de tijd en kosten bij de ontwikkeling van formuleringen door veelbelovende kandidaten te identificeren vóór laboratoriumtests. Het toont de praktische waarde van machine learning aan in de farmaceutische productie – niet alleen in fundamenteel onderzoek.

De adoptie van AI in de farmaceutische industrie bevindt zich nog in een vroeg stadium. Zo'n 36,91 TP3T (Total 3T) organisaties implementeert nog geen machine learning en slechts ongeveer 111 TP3T zet AI volledig in voor alle activiteiten rondom geneesmiddelenontwikkeling. Dit wijst op een aanzienlijk groeipotentieel, maar ook op de huidige beperkingen.

 

Toekomstige richtingen en opkomende technologieën

Machine learning in de farmaceutische industrie blijft zich snel ontwikkelen. Verschillende trends zullen de volgende fase van toepassing bepalen.

Grote taalmodellen en transformatoren

Transformer-architecturen – de basis van grote taalmodellen zoals ChatGPT – worden nu niet alleen meer voor natuurlijke taal gebruikt, maar ook voor moleculair ontwerp. MolBART en vergelijkbare modellen behandelen chemische structuren als sequenties en leren patronen in miljoenen verbindingen.

Deze modellen presteren uitstekend met kleine tot middelgrote datasets (50-240 moleculen) die een hoge diversiteit vertonen. Ze leggen complexe structurele verbanden vast die klassieke modellen over het hoofd zien.

Er blijven echter zorgen over transparantie bestaan. Een onderzoek naar AI-gestuurde manuscriptgeneratie toonde aan dat de voorlopige tekst, rechtstreeks verkregen via ChatGPT, identiek was aan de uiteindelijke versie na menselijke revisie (4,31 TP3T), kleine wijzigingen vertoonde (13,31 TP3T) en een verwante betekenis had (16,31 TP3T). Dit illustreert dat zelfs geavanceerde taalmodellen aanzienlijk menselijk toezicht vereisen.

Multimodale AI-integratie

Toekomstige systemen zullen diverse gegevenstypen integreren: chemische structuren, genoomsequenties, eiwitstructuren, celbeelden, klinische dossiers en literatuurteksten. Deze multimodale aanpak weerspiegelt hoe menselijke experts informatie uit meerdere bronnen synthetiseren.

Vroege voorbeelden combineren beeldvorming, omics-gegevens en klinische variabelen om de respons op de behandeling te voorspellen. Naarmate de data-integratie verbetert, zullen modellen de biologische complexiteit vollediger weergeven.

Gefedereerd leren en gegevensdeling

Kleine datasets beperken de vooruitgang in machine learning in de farmaceutische sector. Tegelijkertijd beperken concurrentieoverwegingen en privacyregelgeving het delen van gegevens tussen organisaties.

Federated learning biedt een oplossing: het trainen van modellen in meerdere instellingen zonder gevoelige gegevens te centraliseren. Algoritmen leren van gedistribueerde datasets, terwijl bedrijfseigen informatie veilig blijft.

Regelgevingsinitiatieven ondersteunen deze richting. De gezamenlijke principes van de FDA en EMA benadrukken de representativiteit en diversiteit van gegevens en stimuleren samenwerking die patiënten ten goede komt zonder intellectueel eigendom in gevaar te brengen.

Continue leersystemen

Traditionele machine learning-modellen zijn statisch: ze worden eenmaal getraind en vervolgens ongewijzigd ingezet. Farmaceutische kennis daarentegen wordt continu opgebouwd naarmate nieuwe experimenten worden afgerond, resultaten van klinische studies worden gerapporteerd en geneesmiddelen op de markt komen.

Systemen die continu leren, actualiseren hun kennis automatisch naarmate er nieuwe gegevens binnenkomen. Het werk van de FDA aan software als medisch hulpmiddel met AI/ML-functionaliteit richt zich op regelgevingskaders voor deze zich ontwikkelende systemen.

Uitdagingen zijn onder meer ervoor zorgen dat updates veilig en effectief blijven, de prestaties van het model valideren naarmate deze veranderen, en een passend toezicht instellen zonder innovatie te belemmeren.

Praktisch implementatieplan

Organisaties die machine learning in de farmaceutische sector willen implementeren, doen er goed aan een stapsgewijze aanpak te volgen in plaats van een volledige transformatie na te streven.

Fase 1: Fundamentopbouw (maanden 1-6)

Begin met het opzetten van een data-infrastructuur. Implementeer gestandaardiseerde processen voor dataverzameling, -opslag en kwaliteitscontrole. Onthoud dat 801.000 ton aan machine learning-werk bestaat uit data-voorbereiding; bezuinigen op dit aspect leidt gegarandeerd tot mislukking.

Identificeer waardevolle toepassingsscenario's met duidelijke succesindicatoren. Richt u op problemen waar machine learning daadwerkelijke voordelen biedt ten opzichte van bestaande methoden. Vermijd toepassingen die meer gebaseerd zijn op hype dan op praktische behoeften.

Stel multidisciplinaire teams samen die domeinexpertise combineren met datawetenschappelijke vaardigheden. Bied trainingen aan zodat wetenschappers de mogelijkheden en beperkingen van machine learning begrijpen, terwijl datateams de principes van de farmaceutische industrie leren.

Fase 2: Pilotprojecten (maanden 6-18)

Start gerichte pilotprojecten die specifieke problemen aanpakken, zoals het voorspellen van de oplosbaarheid van verbindingen, het identificeren van kandidaten voor klinische studies en het optimaliseren van productieparameters. Houd de initiële scope beperkt om snel de waarde aan te tonen.

Valideer de modelprestaties grondig met behulp van geschikte meetwaarden. Vertrouw niet alleen op nauwkeurigheid, maar beoordeel ook de kalibratie, generalisatie naar nieuwe voorbeelden, prestaties in uitzonderlijke gevallen en vergelijk het model met basismodellen.

Documenteer alles. Voor het indienen van regelgevingsdocumenten zijn gedetailleerde verslagen van modelontwikkeling, validatiestudies en prestatiebewakingsplannen vereist. Implementeer deze procedures tijdens pilotprojecten in plaats van ze later toe te voegen.

Fase 3: Gefaseerde uitrol (maanden 18-36)

Succesvolle pilotprojecten uitbreiden naar bredere toepassingen. Machine learning-voorspellingen integreren in besluitvormingsprocessen, maar wel met behoud van menselijk toezicht. AI versterkt expertise, maar vervangt geen oordeel.

Implementeer continue monitoring van de ingezette modellen. De prestaties kunnen afnemen naarmate de dataverdeling verandert of nieuwe biologische mechanismen ontstaan. Stel processen in voor het detecteren van problemen en het bijwerken van modellen.

Betrek toezichthouders vroegtijdig wanneer machine learning (ML) de indiening van documenten kan ondersteunen. De FDA en EMA verwelkomen gesprekken voorafgaand aan de indiening over nieuwe methodologieën. Proactieve betrokkenheid verlaagt de risico's op afwijzing.

Fase 4: Organisatietransformatie (vanaf jaar 3)

Machine learning wordt ingebed in standaardwerkwijzen in plaats van in speciale projecten. Datagestuurde besluitvorming verspreidt zich over alle fasen: onderzoek, ontwikkeling, productie en post-market surveillance.

Investeer in geavanceerde mogelijkheden, zoals federatief leren, multimodale modellen en systemen voor continu leren. Draag bij aan brancheconsortia die gezamenlijke middelen en standaarden ontwikkelen.

Meet de impact kwantitatief. Volg statistieken zoals kortere ontwikkeltijden, hogere slagingspercentages van klinische studies, kostenbesparingen en een snellere marktintroductie. Gebruik deze statistieken om toekomstige investeringen te sturen.

ImplementatiefaseTijdlijnBelangrijkste activiteitenSuccesindicatoren 
Fundamentgebouw0-6 maandenData-infrastructuur, teamvorming, selectie van gebruiksscenario'sSchone datasets, getraind personeel, goedgekeurde piloten.
Proefprojecten6-18 maandenGerichte ML-toepassingen, validatie, documentatieModelprestaties versus basislijn, ROI-demonstratie
Schaalbare implementatie18-36 maandenBredere uitrol, workflowintegratie, betrokkenheid bij regelgevingAdoptiepercentages, impact van beslissingen, gereedheid voor indiening
Transformatie3+ jaarCultuurverandering, geavanceerde mogelijkheden, leiderschap in de sectorVerkorting van de doorlooptijd, verbetering van het slagingspercentage, kostenbesparingen

Ethische overwegingen en verantwoorde AI

Farmaceutische machine learning roept belangrijke ethische vragen op die niet alleen door technische prestaties kunnen worden beantwoord.

Vooroordelen en gezondheidsgelijkheid

ML-modellen leren patronen uit trainingsdata, inclusief de vooroordelen die in die data aanwezig zijn. Als bepaalde populaties in klinische onderzoeken historisch gezien ondervertegenwoordigd waren, kunnen modellen die op basis van onderzoeksresultaten getraind zijn, slecht presteren voor die groepen.

Genomische modellen die voornamelijk zijn getraind op populaties met een Europese achtergrond, vertonen een lagere nauwkeurigheid bij andere genetische achtergronden. Voorspellingen van de respons op medicijnen lijden er eveneens onder wanneer de trainingsdata onvoldoende divers zijn.

Het aanpakken van deze problemen vereist een doelbewuste inspanning om representatieve gegevens te verzamelen, de prestaties binnen subgroepen te valideren en modellen aan te passen wanneer er verschillen aan het licht komen. De FDA-EMA-principes benadrukken juist om deze redenen de representativiteit van gegevens.

Privacy en gegevensbescherming

Farmaceutische machine learning vereist gevoelige gegevens, zoals patiëntendossiers, genetische informatie en behandelresultaten. Het beschermen van de privacy en tegelijkertijd het mogelijk maken van nuttig onderzoek zorgt voor spanning.

Anonimiseringstechnieken helpen, maar zijn niet waterdicht. Met name genomische data kunnen individuen identificeren, zelfs nadat duidelijke identificatoren zijn verwijderd. Federated learning en differentiële privacy bieden technische oplossingen, hoewel dit ten koste gaat van de prestaties.

Regelgeving zoals GDPR en HIPAA stelt eisen waaraan AI in de farmaceutische industrie moet voldoen. Organisaties hebben robuust databeheer nodig om naleving te garanderen en tegelijkertijd innovatie mogelijk te maken.

Transparantie en geïnformeerde toestemming

Wanneer machine learning (ML) van invloed is op behandelbeslissingen of het ontwerp van klinische studies, hebben de betrokkenen er recht op om dat te weten. Maar het uitleggen van complexe modellen aan patiënten en deelnemers aan studies is zelfs voor experts een uitdaging.

In de toestemmingsprocedures moet de betrokkenheid van AI worden toegelicht zonder dat daarvoor diepgaande technische kennis vereist is. Uitleggen welke gegevens het model gebruikt, wat het voorspelt, hoe die voorspellingen beslissingen beïnvloeden en welk menselijk toezicht er is, zorgt voor zinvolle transparantie.

Blackbox-modellen compliceren deze verplichting. Als ontwikkelaars niet kunnen uitleggen waarom een model een bepaalde voorspelling heeft gedaan, wordt het verkrijgen van werkelijk geïnformeerde toestemming lastig.

Belangrijkste conclusies voor farmaceutische organisaties

Wat betekent dit voor de farmaceutische ontwikkeling in 2026?

Machine learning levert daadwerkelijke waarde op in de geneesmiddelenontwikkeling, klinische studies en regelgevingsprocessen, maar het is geen wondermiddel dat alle problemen oplost. Het succespercentage van de goedkeuring van 8–10%-medicijnen verbetert geleidelijk, in plaats van van de ene op de andere dag te veranderen. Machine learning versterkt menselijke expertise; het vervangt geen gedegen wetenschap.

Organisaties die succesvol zijn met AI in de farmaceutische industrie hebben gemeenschappelijke kenmerken:

  • Ze geven prioriteit aan datakwaliteit boven de complexiteit van het model: Schone, zorgvuldig samengestelde datasets zijn belangrijker dan de nieuwste architectuur. Het is geen fout dat er 801 TP3T aan inspanning wordt besteed aan datavoorbereiding, maar de realiteit van effectieve machine learning.
  • Ze koppelen modellen aan problemen: Few-shot learning voor kleine datasets, transformermodellen voor diverse middelgrote datasets, klassieke methoden voor grote datasets. De context bepaalt de optimale aanpak.
  • Ze houden realistische verwachtingen aan: Diepgaande leermodellen presteren soms niet beter dan eenvoudige basismodellen. Inzicht in wanneer machine learning waarde toevoegt en wanneer traditionele methoden volstaan, voorkomt onnodige inspanningen.
  • Ze omarmen samenwerking met regelgevende instanties: De gezamenlijke principes van de FDA en EMA van januari 2026 bieden een routekaart. Door deze richtlijnen vanaf het begin te volgen, worden kostbare aanpassingen achteraf voorkomen.
  • Ze bouwen multidisciplinaire teams op: Datawetenschappers hebben domeinkennis van de farmaceutische industrie nodig. Wetenschappers moeten de mogelijkheden en beperkingen van machine learning begrijpen. Een combinatie van expertise leidt tot succes.
  • Ze pakken ethische overwegingen proactief aan: Vooroordelen, privacy, transparantie en gelijkheid zijn geen bijkomstigheden, maar ontwerpeisen voor verantwoorde AI.

De farmaceutische industrie bevindt zich op een keerpunt. Machine learning biedt concrete mogelijkheden om de ontwikkeling te versnellen, de kosten te verlagen en de resultaten voor patiënten te verbeteren. Maar om dit potentieel te realiseren, moeten we verder kijken dan de hype en overgaan tot een doordachte implementatie, gebaseerd op datakwaliteit, de juiste methodologie en afstemming met de regelgeving.

Kijk: de technologie bestaat. De regelgeving is in ontwikkeling. De vraag is nu hoe we machine learning kunnen implementeren waar het echt waarde oplevert, en tegelijkertijd de valkuilen vermijden die eerdere AI-golven in de gezondheidszorg hebben doen ontsporen.

Veelgestelde vragen

Wat is het huidige succespercentage bij de ontwikkeling van geneesmiddelen en hoe verbetert machine learning dit?

Het algehele succespercentage van fase I tot goedkeuring ligt gemiddeld rond de 8–10%. Programma's die gebruikmaken van machine learning laten in sommige gevallen een hoger succespercentage zien bij de overgang naar de volgende fase (bijvoorbeeld tot wel 12% in specifieke toepassingen), hoewel de algehele succespercentages uitdagend blijven.

Welke machine learning-methoden werken het beste voor verschillende farmaceutische datasets?

De optimale machine learning-aanpak hangt af van de grootte en diversiteit van de dataset. Few-shot learning-modellen presteren het best bij kleine datasets met minder dan 50 moleculen. Transformer-modellen zoals MolBART blinken uit bij kleine tot middelgrote datasets (50-240 moleculen) met een hoge diversiteit. Klassieke modellen zoals support vector regression en random forests presteren het best bij grotere datasets met voldoende voorbeelden. Dit 'gouden middenweg'-raamwerk helpt teams bij het selecteren van de juiste algoritmen in plaats van automatisch voor de nieuwste architectuur te kiezen.

Welke regelgeving is er voor het gebruik van AI bij de ontwikkeling van geneesmiddelen?

De FDA publiceerde op 6 januari 2025 een conceptrichtlijn over AI voor geneesmiddelenontwikkeling, waarin systemen worden behandeld die bedoeld zijn om regelgevende beslissingen over veiligheid, werkzaamheid of kwaliteit te ondersteunen. Op 14 januari 2026 hebben de FDA en het Europees Geneesmiddelenagentschap (EMA) gezamenlijk tien principes voor goede AI-praktijken in de gehele levenscyclus van geneesmiddelen vastgesteld. Deze principes benadrukken transparantie, datakwaliteit, validatie, menselijk toezicht en ethische overwegingen. Het EMA publiceert ook kwalificatieadviezen voor specifieke AI-tools, zoals het op AI gebaseerde meetsysteem voor histologie van niet-alcoholische steatohepatitis, dat tussen december 2024 en januari 2025 ter consultatie beschikbaar is voor het publiek.

Wat zijn de grootste uitdagingen bij de implementatie van machine learning in de farmaceutische industrie?

De datakwaliteit vormt de grootste uitdaging: 801 TP3T van de machine learning-inspanningen gaat naar het opschonen en verwerken van data, tegenover 201 TP3T aan algoritmen. Kleine datasets beperken de training en generalisatie van modellen. Modellen laten een scherpe daling in nauwkeurigheid zien bij onbekende verbindingen in vergelijking met willekeurig verdeelde trainingsdata. IC50-metingen variëren met 4001 TP3T tussen verschillende assayprotocollen, wat ruis in de trainingsdata veroorzaakt. Organisatorische barrières spelen ook een rol: 36,91 TP3T van farmaceutische organisaties was nog niet begonnen met de implementatie van AI in belangrijke ontwikkelingsactiviteiten. Culturele weerstand, gebrek aan expertise tussen verschillende afdelingen en de moeilijkheid om de ROI aan te tonen, vertragen de adoptie buiten pilotprojecten.

Hoe nauwkeurig zijn de huidige machine learning-modellen voor het ontdekken en ontwikkelen van geneesmiddelen?

De nauwkeurigheid varieert per toepassing. Deep learning-modellen behalen een hoge nauwkeurigheid bij het valideren van eiwit-eiwitinteracties. Machine learning-benaderingen, waaronder reinforcement learning, bereiken een hoge nauwkeurigheid bij het scoren van moleculaire bindingsfuncties. Classificatiemodellen en random forest-benaderingen laten sterke prestaties zien bij het voorspellen van biomarkerprofielen en het analyseren van medicamenteuze behandelingen. Benchmarkstudies tonen echter aan dat deep learning-modellen voor de potentie van antikankermedicijnen vaak niet significant beter presteren dan eenvoudige, op gemiddelden gebaseerde basismodellen, met name voor nieuwe verbindingen. Context is enorm belangrijk: de gerapporteerde nauwkeurigheid op trainingsdata of bekende voorbeelden overtreft vaak de werkelijke prestaties bij nieuwe moleculen.

Welk rendement kunnen farmaceutische bedrijven verwachten van investeringen in machine learning?

Het kwantificeren van de ROI blijft lastig vanwege de lange ontwikkeltijden. Belangrijke voordelen zijn onder meer lagere kosten en kortere ontwikkeltijden voor patiënten (wat kan oplopen tot zo'n 301 TP3T aan onderzoeksbudgetten), snellere identificatie van veelbelovende kandidaten en een hogere slagingskans bij faseovergangen.
Machine learning kan helpen om het totale doorlooptijdspercentage van fase I tot goedkeuring te verhogen van het huidige branchegemiddelde van ~8-101 TP3T, hoewel de verbeteringen eerder stapsgewijs dan dramatisch zullen zijn. Focus op meetbare metrics: verkorting van de doorlooptijd, hoger succespercentage in de vroege fase en kostenbesparingen in specifieke processen.

Hoe kunnen kleinere farmaceutische en biotechnologische bedrijven machine learning implementeren zonder enorme middelen te hoeven investeren?

Begin met gerichte toepassingen die specifieke, waardevolle problemen aanpakken in plaats van te streven naar een alomvattende transformatie. Maak gebruik van voorgegetrainde modellen en transfer learning om de datavereisten te minimaliseren. Werk samen via brancheconsortia en federatieve leerinitiatieven die kennis bundelen zonder bedrijfseigen data te delen. Gebruik cloudgebaseerde ML-platforms die investeringen in infrastructuur overbodig maken. Werk samen met academische instellingen en contractonderzoeksorganisaties die ML-expertise aanbieden. Richt de eerste inspanningen op datakwaliteit en -standaardisatie: schone datasets maken effectieve ML mogelijk, zelfs met eenvoudigere modellen. Overweeg klassieke algoritmen (support vector machines, random forests) die sterke prestaties leveren bij veel farmaceutische taken zonder dat daarvoor specialistische expertise of rekenkracht nodig is, zoals bij deep learning.

Conclusie

Machine learning is in de farmaceutische ontwikkeling geëvolueerd van theoretische belofte naar praktische realiteit. De gezamenlijke principes van de FDA en EMA van januari 2026 markeren de wettelijke acceptatie van AI in de gehele levenscyclus van geneesmiddelen. Succesverhalen tonen een meetbare impact aan op het gebied van geneesmiddelenonderzoek, formulering, klinische studies en indiening van regelgevingsdocumenten.

Maar er blijven aanzienlijke uitdagingen bestaan. Problemen met de datakwaliteit, kleine datasets, zorgen over de interpreteerbaarheid van modellen en organisatorische belemmeringen vertragen de acceptatie. Het klinische succespercentage van ~8–10% verbetert geleidelijk in plaats van van de ene op de andere dag te veranderen.

Succesvolle organisaties geven prioriteit aan data-infrastructuur boven de complexiteit van algoritmen, stemmen modellen af op problemen op basis van de kenmerken van de dataset, koesteren realistische verwachtingen over wat machine learning kan bereiken, gaan proactief in gesprek met toezichthouders, bouwen expertise op over verschillende disciplines heen en pakken ethische overwegingen vanaf het begin aan.

De farmaceutische industrie heeft decennialang traditionele methoden geoptimaliseerd. Machine learning biedt een fundamenteel andere weg – een weg die leert van data in plaats van uitsluitend te vertrouwen op mechanistisch inzicht. Beide benaderingen hebben waarde. De toekomst behoort toe aan organisaties die ze effectief integreren.

Bent u klaar om machine learning in de farmaceutische sector in uw organisatie te implementeren? Begin met het beoordelen van uw data-infrastructuur en het identificeren van waardevolle use cases waar voorspellende modellen daadwerkelijke knelpunten aanpakken. Stel multidisciplinaire teams samen, start gerichte pilots, valideer grondig en schaal op wat werkt. De technologie is er klaar voor. De regelgeving is in ontwikkeling. De kans is er nu.

Laten we samenwerken!
nl_NLDutch
Scroll naar boven